新生儿贫血的原因有多种。一般来说，胎儿期从母体获得的铁储备不足、胎儿出血以及红细胞破坏增多等都可能导致新生儿贫血。比如，若母亲和胎儿血型不合，就可能引发新生儿溶血性贫血，这是比较常见的原因之一。
胎儿期铁储备不足导致
胎盘输血不足： 如果在分娩过程中，胎盘向胎儿输血的时间过短，胎儿就可能获得的铁等营养物质不足。正常情况下，胎盘输血一般在分娩后的几分钟内完成，但如果出现胎盘早剥等情况，可能会影响胎盘输血的时长和量，进而导致胎儿铁储备不够，引发贫血。早产因素： 早产儿发生贫血的风险相对较高。因为早产儿在母体内的发育时间较短，从母体获取铁等营养物质的时间不够，体内储存的铁量比足月儿少。例如，孕周小于32周的早产儿，发生贫血的概率明显高于足月儿。
胎儿出血引起
胎 - 母输血： 胎儿的血液可能会通过胎盘的血管进入母体循环，这种胎 - 母输血如果发生量较大，就会导致胎儿贫血。比如，在孕期如果母亲有腹部受到撞击等情况，可能会增加胎 - 母输血的风险。胎 - 胎输血： 双胎或多胎妊娠时，可能会发生胎 - 胎之间的输血。一个胎儿的血液通过胎盘血管流向另一个胎儿，导致供血胎儿出现贫血。这种情况在单绒毛膜双胎中较为常见，大约有10% - 15%的单绒毛膜双胎会发生胎 - 胎输血综合征，引起供血儿贫血。
红细胞破坏增多导致
新生儿溶血病： 当母婴血型不合时，如母亲是O型血，胎儿是A型或B型血，母亲体内的抗体就可能通过胎盘进入胎儿体内，破坏胎儿的红细胞，导致新生儿溶血性贫血。据统计，ABO血型不合引起的新生儿溶血病约占新生儿溶血病的一半左右。红细胞酶缺陷： 新生儿体内某些红细胞酶缺乏也会导致红细胞破坏增多。例如，葡萄糖 - 6 - 磷酸脱氢酶（G - 6 - PD）缺乏症，这种酶缺乏会使红细胞容易受到氧化物质的损伤，从而发生溶血，导致贫血。