新生儿贫血的原因有多种。一般来说，胎儿期失血、母体因素、胎儿自身造血问题等都可能导致新生儿贫血。其中，胎儿期失血约有15% - 20%的新生儿会因胎盘输血失衡等情况出现胎儿期失血，从而引发贫血。
一、胎儿期失血相关原因
胎盘输血失衡： 胎盘是胎儿获取营养和氧气的重要器官，如果胎盘发生异常，比如双胎输血综合征，一个胎儿向另一个胎儿输血，就可能导致其中一个胎儿出现失血，进而引发贫血。一般这种情况在双胎妊娠中较为常见。脐带异常： 脐带的过度扭转、打结等异常情况会影响胎儿的血液供应，导致胎儿失血，引起贫血。例如脐带过度扭转时，会使脐带血管腔变窄甚至闭塞，阻碍血液流通，造成胎儿失血。
二、母体因素导致
母体贫血影响： 如果孕妇本身存在贫血问题，比如缺铁性贫血等，那么通过胎盘传递给胎儿的铁等营养物质相对不足，可能会影响胎儿的造血，导致新生儿贫血。孕妇缺铁性贫血较为常见，约有相当比例的孕妇会出现这种情况。药物影响： 孕妇在孕期服用某些药物也可能影响胎儿造血，进而导致新生儿贫血。比如孕妇服用某些抗癫痫药物等，可能会对胎儿造血系统产生不良影响。
三、胎儿自身造血问题
红细胞生成障碍： 胎儿自身的造血系统如果出现问题，比如先天性再生障碍性贫血等疾病，会导致红细胞生成减少，从而引发贫血。先天性再生障碍性贫血是一种较为罕见但严重的疾病，会影响胎儿的正常造血功能。红细胞破坏过多： 胎儿自身的红细胞破坏过多也会造成贫血。比如新生儿先天性葡萄糖 - 6 - 磷酸脱氢酶（G - 6 - PD）缺乏症，会导致红细胞容易被破坏，引起溶血性贫血。这种酶缺乏在一些地区的新生儿中也有一定的发生率。