会厌囊肿的治疗方式主要有手术治疗和保守观察等。对于较小的无症状会厌囊肿，可选择保守观察，定期复查喉镜，观察囊肿变化情况。而对于较大的、有明显症状的会厌囊肿，通常需要手术治疗。
手术治疗方式
支撑喉镜下囊肿切除术：这是常用的手术方法。通过支撑喉镜暴露会厌囊肿，然后用激光、电刀等将囊肿切除。手术一般在局部麻醉或全身麻醉下进行，能较为彻底地去除囊肿。显微镜下会厌囊肿切除术：利用显微镜的放大作用，更精细地操作，可减少对周围组织的损伤，尤其适合囊肿位置较特殊、解剖结构复杂部位的囊肿切除。
保守观察情况
无症状小囊肿：如果会厌囊肿较小，患者没有咽喉部异物感、吞咽梗阻等明显症状，医生可能会建议定期（一般每3 - 6个月）进行喉镜检查，观察囊肿大小、形态等有无变化。只要囊肿没有明显增大或引发不适症状，就可以继续观察。特殊人群的保守观察：对于一些年老体弱、基础疾病较多，无法耐受手术的患者，若会厌囊肿较小且无症状，也会采取保守观察的方式，但需要密切关注病情变化。
术后注意事项
饮食方面：术后短期内要避免进食过热、过硬的食物，以防刺激手术部位。一般建议先吃温凉的流质或半流质食物，如米粥、蛋羹等，逐渐过渡到软食，大约1 - 2周后可恢复正常饮食，但仍要注意避免辛辣、刺激性食物。口腔卫生：要保持口腔清洁，经常漱口，防止口腔细菌感染手术创面，可使用复方氯己定含漱液等进行漱口，每天3 - 4次。休息与复诊：患者需要适当休息，避免过度用嗓。按照医生要求按时复诊，一般术后1周、1个月等时间点要进行喉镜复查，了解创面愈合情况。如果出现咽喉部剧烈疼痛、出血、呼吸困难等异常情况，要立即就医。