怀孕三个月肚子疼可能有以下情况：
一、正常表现：怀孕后，随着胚胎生长发育，子宫腔内容积逐步增大，膨大的子宫对腹壁形成压迫，就可能引发肚子疼。
二、先兆流产：怀孕三个月时，孕妇若受到剧烈精神刺激或腹部遭受外力撞击，可能诱发子宫收缩，进而导致先兆流产，使孕妇出现肚子疼痛，同时还可能伴有阴道流血、腰骶部酸痛等症状。
三、盆腔炎：怀孕三个月的孕妇，若身体免疫功能下降，致使细菌等病原进入盆腔，可引起盆腔组织出现炎性病变，导致肚子疼，还可伴有分泌物增多、有异味、发热、寒战、倦怠、疲乏等表现。
总之，引起孕妇三个月肚子疼的原因较多，需要在专业医生指导下，依据具体病因进行治疗。