治疗心脏官能症的药物选择需根据具体症状来定。一般来说，对于伴有焦虑抑郁情绪的患者，可能会用到抗焦虑抑郁的药物。比如常用的有选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，像帕罗西汀等，这类药物可以调节神经递质，改善患者的焦虑抑郁状态，一般需要长期服用，但具体用药要遵循医嘱。
调节自主神经功能的药物
谷维素： 它是从米糠油中提取的一种维生素类药物，能调节自主神经功能，改善精神神经失调症状。一般成人一次10 - 30毫克，一日3次。它相对比较安全，副作用较少，但也需在医生指导下使用。维生素B1： 属于水溶性维生素，参与体内辅酶的形成，能维持神经、心脏及消化系统的正常功能。通常成人一次10毫克，一日3次。如果缺乏维生素B1可能会影响神经功能，适当补充有助于心脏官能症患者神经功能的调节。
针对焦虑抑郁症状的药物
帕罗西汀： 是选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂，可有效缓解心脏官能症患者伴随的焦虑、抑郁情绪。它通过抑制突触前膜对5 - 羟色胺的再摄取，增加突触间隙5 - 羟色胺浓度，从而发挥抗抑郁、抗焦虑作用。不过，使用时要注意可能出现一些副作用，如恶心、嗜睡、头痛等，而且18岁以下儿童使用需谨慎评估。艾司西酞普兰： 也是一种选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂，适用于治疗伴有焦虑或抑郁症状的心脏官能症患者。它能改善患者的情绪状态，一般起始剂量为每日10mg，根据患者的反应可增加至每日20mg。但同样要注意药物的不良反应，如口干、失眠、震颤等，并且孕妇、哺乳期妇女以及儿童使用需格外谨慎。
缓解心悸等症状的药物
β受体阻滞剂： 像普萘洛尔，它可以阻断心脏的β受体，减慢心率，降低心肌收缩力，从而缓解心悸等症状。不过，支气管哮喘患者禁用，因为它可能会诱发支气管痉挛。成人常用量口服，一次10 - 30mg，一日3 - 4次。但具体用量要根据患者的心率、血压等情况由医生调整，而且用药过程中要密切监测心率和血压变化。稳心颗粒： 这是一种中成药，由党参、黄精、三七、琥珀、甘松等组成，具有益气养阴、活血化瘀的功效，可用于治疗气阴两虚、心脉瘀阻所致的心悸不宁、气短乏力、胸闷胸痛等症状，对心脏官能症引起的心悸等有一定的缓解作用。一般一次1袋，一日3次，开水冲服。相对来说副作用较小，但也不能自行随意增减剂量，需要在医生指导下使用。