心脏官能症的治疗药物需根据具体症状来选择，一般会用到调节植物神经功能的药物，比如谷维素，它可以调节植物神经功能，通常一次10 - 30毫克，一日3次。还有β受体阻滞剂，像普萘洛尔，能改善心悸等症状，一般开始用量为10 - 20毫克，一日3次。
调节植物神经功能药物
谷维素： 是从米糠油中提取的一种维生素类药物，能调整自主神经功能，减少内分泌平衡障碍，改善精神神经失调症状。通常成人一次服用10 - 30毫克，一天服用3次。一般来说，服用后几周内可能会看到症状改善，但具体起效时间因人而异。维生素B1： 属于水溶性维生素，是人体正常代谢所需的物质，对神经系统有维护作用。可以口服，一次10毫克，一日3次。它能参与体内辅酶的形成，帮助维持神经、消化等系统的正常功能。
β受体阻滞剂类药物
普萘洛尔： 能阻断心脏上的β1受体，减慢心率，减弱心肌收缩力，减少心肌耗氧量。一般初始剂量为一次10 - 20毫克，一日3次。不过，患有支气管哮喘的患者禁用，因为它可能会诱发哮喘发作。同时，严重心动过缓、重度房室传导阻滞患者也不能使用。美托洛尔： 也是β受体阻滞剂，可用于治疗心悸等症状。口服剂量一般为一次12.5 - 100毫克，一日2次。使用时要注意，严重心力衰竭、心源性休克患者禁用，而且用药过程中要密切监测心率和血压。
抗焦虑抑郁药物
黛力新： 由氟哌噻吨和美利曲辛组成，适用于轻度至中度的焦虑和抑郁状态。成人通常每天2次，早晨及中午各1片；严重病例早晨的剂量可加至2片。但患有严重心脏病的患者要慎用，比如近期发生心肌梗死的患者。帕罗西汀： 属于选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂，能改善焦虑、抑郁情绪。一般初始剂量为一天20毫克，根据患者的反应和耐受性，可逐渐增加剂量，最大剂量不超过一天50毫克。不过，肝功能不全者要慎用，而且服用过程中可能会出现恶心、口干等不良反应。