男人小便会痛可能是尿道炎、膀胱炎、细菌性前列腺炎等原因，也可能是前列腺增生、精囊炎、膀胱结石等其他疾病。
一、尿道炎：
该疾病主要是因平时未注意尿道清洁，导致致病菌入侵所致。其可能出现的症状包括小便后疼痛、尿血等。尿道炎患者在排尿时，由于尿道受到炎症刺激，会产生尿痛感。同时，炎症还可能导致尿道黏膜损伤，引起尿血现象。
二、膀胱炎：
通常在排尿中或排尿结束时出现疼痛，多为膀胱炎。除了尿痛症状外，还会有尿频、尿急、憋不住尿以及肉眼血尿等表现。膀胱炎患者的这些症状主要是由于膀胱受到炎症刺激，其正常功能受到影响。尿频是因为炎症刺激使膀胱敏感性增加，导致排尿次数增多；尿急则是因为患者难以控制排尿的急迫感；憋不住尿也是由于膀胱不能正常憋尿；肉眼血尿则是因为膀胱黏膜的损伤导致血液进入尿液。
三、细菌性前列腺炎：
细菌性前列腺炎是由细菌感染前列腺引发的炎症，炎性物质渗出会刺激尿道正常结构，导致尿道黏膜受损。在排尿时，尿液会刺激到损伤的尿道黏膜，从而出现男性尿痛的症状。前列腺的炎症会使前列腺分泌的炎性物质增多，这些炎性物质会渗出到尿道，刺激尿道引起尿痛。
四、其他疾病：
(1)前列腺增生：可能导致小便疼痛等症状。
(2)精囊炎：也可能与小便疼痛有关。
(3)膀胱结石：会引起排尿异常和疼痛。
如果小便疼痛的情况长期存在，或持续不能缓解，建议前往医院专科科室进行相应的影像学检查，以查找病因并对症处理。