男人小便时尿道疼痛，可能与以下原因有关：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、病毒等感染引起。除了尿道疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。
淋菌性尿道炎：主要由淋病奈瑟菌感染引起，多通过性接触传播。患者尿道口会出现大量脓性分泌物，排尿时疼痛明显。
非淋菌性尿道炎：由沙眼衣原体、支原体等感染引起。患者尿道口可有少量分泌物，排尿时尿道轻微灼热感、刺痒感。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，也可导致小便时尿道疼痛。常伴有尿频、尿急、尿痛等症状，有时还会出现血尿。
3.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，除了会引起会阴部、耻骨上区疼痛，还可能导致排尿异常，如尿频、尿急、尿痛、尿不尽等。
4.尿道结石：尿道结石可阻塞尿道，导致排尿不畅，同时伴有明显的尿道疼痛，有时还会出现血尿。
5.其他原因：尿道口局部损伤、尿道狭窄、泌尿系统结核等也可能导致小便时尿道疼痛。
需要注意的是，尿道疼痛可能是一种症状，也可能是某些疾病的表现。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、B超等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。