植物神经功能紊乱的治疗需综合多方面因素，一般可通过心理调节、生活方式调整及药物辅助等方法改善，其中心理调节对部分患者很重要，约30% - 50%的患者通过心理疏导能有明显好转。
心理调节方面
情绪管理：要保持心态平和，避免长期处于焦虑、紧张、抑郁等不良情绪中。可以通过听舒缓的音乐、冥想等方式来放松身心，每天抽出15 - 30分钟进行冥想，有助于稳定情绪。心理咨询：如果自我调节效果不佳，可寻求专业心理咨询师的帮助，进行心理疏导，心理咨询一般按小时收费，每次大概100 - 500元不等。
生活方式调整方面
作息规律：保证充足且规律的睡眠，每晚尽量保证7 - 8小时的睡眠时间。建立固定的作息时间表，每天尽量在相同时间上床睡觉和起床。适度运动：坚持适度的体育运动，如散步、慢跑、瑜伽等。每周至少进行3次运动，每次运动30分钟以上。像散步可以选择在饭后1小时左右，每天走6000 - 10000步，能促进身体血液循环，改善植物神经功能。
药物辅助方面
调节神经药物：对于症状较明显的患者，可在医生指导下使用调节植物神经功能的药物，如维生素B族，包括维生素B1、维生素B6、维生素B12等，它们参与神经系统的代谢，有助于维持神经功能正常。一般来说，维生素B族的日常补充剂量按说明书服用即可，但具体使用需遵医嘱。对症治疗药物：如果伴有失眠症状，可短期使用助眠药物，如佐匹克隆等；若出现心悸等心脏相关症状，可根据情况使用改善心悸的药物，但都需在医生的专业指导下使用。
饮食调节方面
均衡饮食：保证饮食的均衡，摄入富含营养的食物，如多吃蔬菜、水果、全谷类食物等。蔬菜每天的摄入量建议在500克左右，其中绿叶蔬菜应占一半以上。避免刺激性食物：减少咖啡、浓茶、酒精等刺激性饮品的摄入，因为咖啡和浓茶中的咖啡因可能会加重植物神经功能紊乱的症状，每天咖啡摄入量最好不超过2杯（每杯约150毫升），酒精则应尽量避免饮用。