生殖器疱疹与毛囊炎在多个方面存在区别，具体包括感染类型不同、临床症状不同、治疗方法不同。若患者出现相关症状，应及时到医院，由专业医生判断并明确具体类型。
一、感染类型不同
1.生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的皮肤疾病，主要通过性行为传播。
2.毛囊炎主要由金黄色葡萄球菌感染导致，少数也可能由铜绿假单胞菌、马拉色菌引起，通常不具有传染性。
二、临床症状不同
1.生殖器疱疹患者主要表现为生殖器周围皮肤出现水疱，水疱数量较多且密集，伴有不同程度的灼热感或疼痛感。
2.毛囊炎患者可在全身各处出现丘疹样皮肤损害，通常数量较少，有时会伴有疼痛，但疼痛往往不明显。
三、治疗方法不同
1.对于生殖器疱疹患者，需要进行抗病毒治疗，可在医生指导下服用阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物，或外涂阿昔洛韦乳膏。
2.毛囊炎患者需针对不同病原体采取相应治疗措施。若存在细菌感染，可外涂莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏，或口服阿莫西林、四环素等。对于真菌感染，则可外用特比萘芬乳膏、酮康唑洗剂等，或口服伊曲康唑、氟康唑等。
总之，生殖器疱疹和毛囊炎在感染类型、临床症状和治疗方法上都有明显区别，准确的诊断和恰当的治疗对于患者的康复至关重要。