克罗恩病是一种慢性炎性肉芽肿性肠道疾病，其症状多样。通常来说，克罗恩病常见的症状包括腹痛，约有70% - 90%的患者会出现不同程度的腹痛，多为右下腹或脐周隐痛，有时呈痉挛性疼痛，进食后加重，排便后可暂时缓解。
肠道相关症状
腹泻： 也是常见症状之一，多数患者有腹泻表现，排便次数从每日数次到十余次不等，粪便多为糊状，一般无脓血和黏液，但病变累及结肠下段或直肠时，可有黏液血便。腹部包块： 约10% - 20%的患者可出现腹部包块，多位于右下腹与脐周，由于肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致。
全身症状
发热： 约1/3的患者会出现发热，多为间歇性低热或中度热，少数呈弛张高热伴毒血症。有时发热是本病的首发症状，可伴有盗汗等表现。营养不良： 由于肠道吸收不良、慢性消耗等原因，患者可出现体重减轻、贫血、低蛋白血症等营养不良表现，儿童患者还可能影响生长发育。
肠外表现
口腔黏膜溃疡： 部分患者会出现口腔黏膜的溃疡，表现为口唇、颊黏膜等部位的溃疡，疼痛可能影响进食。关节病变： 约10% - 20%的患者有关节炎，以外周关节受累为主，可表现为非对称性、游走性的关节炎或关节痛，部分患者还可能出现骶髂关节炎等。皮肤病变： 有些患者会出现皮肤结节性红斑，多见于下肢，表现为红色结节，有压痛；也可能出现坏疽性脓皮病，表现为皮肤的溃疡性病变。