子宫内膜薄可能由多种原因导致，其中内分泌失调较为常见。比如，雌激素水平不足是引发子宫内膜薄的重要因素之一，有研究表明约30% - 40%的子宫内膜薄患者存在雌激素分泌异常情况。
内分泌因素
内分泌疾病影响： 像多囊卵巢综合征，患者体内激素失衡，会干扰子宫内膜的正常生长。这类患者往往排卵异常，进而影响雌激素的分泌，使得子宫内膜难以增厚。甲状腺功能减退也可能波及子宫内膜，甲状腺激素分泌不足会影响全身代谢，包括子宫内膜的生长环境，导致子宫内膜变薄。人工流产术后损伤： 频繁人工流产会对子宫内膜造成直接伤害。一般来说，做一次人工流产，子宫内膜受损的概率就会增加，多次人工流产后，子宫内膜基底层可能被破坏，从而引起子宫内膜薄。而且术后如果发生宫腔粘连，也会阻碍子宫内膜的正常生长。
子宫病变因素
宫腔手术史： 除了人工流产，子宫肌瘤剔除术等宫腔手术也可能损伤子宫内膜。例如，子宫肌瘤剔除术时，手术操作可能会破坏部分子宫内膜组织，影响其正常厚度。子宫腔感染也会影响子宫内膜，比如子宫内膜炎，炎症会破坏子宫内膜的正常结构和功能，导致子宫内膜变薄。先天性子宫发育异常： 有些女性先天性子宫发育不良，子宫体积较小，子宫内膜也相对较薄。这种情况往往从青春期开始就可能表现出月经异常等相关症状，子宫内膜厚度始终达不到正常范围。
其他因素
年龄因素： 随着年龄增长，女性体内激素水平逐渐发生变化，子宫内膜也会随之出现变薄趋势。一般35岁以上的女性，子宫内膜变薄的概率比年轻女性要高一些。长期服用某些药物也可能影响子宫内膜，比如长期服用避孕药，可能会抑制子宫内膜的生长，导致子宫内膜变薄。