肝胆管结石的形成通常与多种因素相关。目前认为，胆道感染、胆汁淤积以及胆道寄生虫感染等是引发肝胆管结石的主要原因。比如，有研究显示，约有50% - 80%的肝胆管结石患者存在胆道感染的病史。
一、胆道感染因素
细菌感染影响：胆道发生细菌感染时，细菌产生的一些物质会改变胆汁的成分。例如，大肠杆菌等细菌感染后，可能会使胆汁中的胆盐、磷脂等成分比例失调，从而容易促使结石形成。细菌还能作为核心，吸引胆汁中的成分逐渐沉积形成结石。寄生虫感染关联：胆道蛔虫症是常见的引发肝胆管结石的寄生虫因素。蛔虫进入胆道后，其尸体或虫卵会成为结石的核心，胆汁中的胆红素钙等物质会围绕这个核心沉积，进而形成结石。据统计，因胆道蛔虫导致的肝胆管结石患者占一定比例。
二、胆汁淤积因素
胆道狭窄导致淤积：胆道本身存在狭窄情况，比如先天性胆道狭窄或者胆道手术后瘢痕狭窄等，会使胆汁排出不畅，胆汁长期淤积在胆道内。胆汁中的胆色素、胆固醇等成分就会逐渐沉淀，久而久之形成结石。例如，先天性胆道闭锁的患儿，发生肝胆管结石的风险相对较高。胆汁成分异常：如果胆汁中胆固醇、胆红素等成分比例失常，也会引起胆汁淤积。比如，一些人由于代谢异常等原因，胆汁中胆固醇含量过高，就容易形成以胆固醇为主的结石；而胆红素代谢异常时，会导致胆红素钙沉淀形成胆红素结石。
三、其他相关因素
饮食习惯影响：长期高脂肪、高胆固醇饮食的人，胆汁中胆固醇含量升高，增加了肝胆管结石形成的风险。比如，一些经常大量食用油炸食品、动物内脏的人群，患肝胆管结石的几率相对较高。地域与种族差异：在某些地区，肝胆管结石的发病率相对较高，可能与当地的水质、饮食结构等地域因素有关。而且不同种族人群的肝胆管结石发病情况也可能存在差异，这可能与遗传等多种因素相关，但具体机制仍在研究中。