药物流产没有流干净可能产生多种不良影响，包括对子宫内膜造成伤害、引发宫腔感染、引发妇科疾病等。
一、对子宫内膜造成伤害：药物流产若没流干净，残留组织进入宫腔且无法排出时可能植入宫腔，进而对子宫内膜形成一定损害。
二、引发宫腔感染：子宫腔内残留组织会导致阴道出血频繁、不规则以及感染，甚至可能引发贫血。比如会出现长时间的阴道流血，血液可能会滋生细菌等病原微生物，引发感染。
三、引发妇科疾病：若长时间未清理干净，很容易导致病原微生物感染，诱发子宫内膜炎、盆腔炎等炎症性疾病，同时还可能伴有全身症状，如发烧、疲劳、严重腹痛以及阴道内分泌异常分泌物等。
药物流产没有流干净的治疗方法如下：当药物流产残留小于1厘米时，可以在医生指导下口服益母草颗粒、新生化颗粒等药物促进血液循环、清除血瘀，以帮助子宫恢复正常；如果残留超过1厘米，则需要再次进行宫腔清理操作，以免残留物长时间存在于宫腔内而对身体造成损伤，进而影响未来妊娠。
总之，药物流产没流干净危害较大，应根据具体情况选择合适的治疗方法及时处理。