经常爱起口腔溃疡的原因有多种。一般来说，复发性阿弗他溃疡的人群中，约10%~25%有阳性家族史。
一、免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，可能会攻击自身口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡。比如一些患有自身免疫性疾病的人群，像白塞病患者，口腔溃疡往往是较为常见的症状之一，且容易反复发作。免疫力低下： 当身体整体免疫力降低时，比如长期疲劳、睡眠不足、营养不良等情况，就更容易受到病原体的侵袭，口腔黏膜的防御能力减弱，也就容易频繁出现口腔溃疡。例如，长期熬夜的人，相较于作息规律的人，口腔溃疡的发生几率可能会更高。
二、营养缺乏
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B₂、B₁₂等）和维生素C的缺乏，会影响口腔黏膜的正常代谢。比如长期吃素且饮食单一的人，容易缺乏维生素B₂，就比较容易长口腔溃疡。一般来说，正常成年人每天需要摄入一定量的维生素B₂，男性约1.4毫克，女性约1.2毫克等。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素的缺乏也与口腔溃疡的发生有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，缺乏锌时会影响细胞的正常分裂和修复，从而导致口腔溃疡频繁出现。正常成年人每天锌的摄入量男性约15.5毫克，女性约11.5毫克等。
三、局部刺激因素
牙齿残冠残根： 口腔内如果有锐利的牙齿残冠、残根，长期摩擦口腔黏膜，就会反复刺激局部，导致口腔溃疡反复发生。比如牙齿被龋坏后形成尖锐的边缘，长时间摩擦颊黏膜等部位，就容易引起口腔溃疡。不良修复体： 不合适的假牙等修复体，佩戴后与口腔黏膜不贴合，长期摩擦或刺激黏膜，也会引发口腔溃疡。例如，假牙制作不合适，佩戴一段时间后就可能导致口腔黏膜出现破损、溃疡等情况。