小儿反复发烧的原因有多种。其中感染性因素较为常见，比如病毒感染，像流感病毒引起的流感，可能会导致小儿反复发烧，病程一般可持续3 - 5天左右；细菌感染也是常见原因，如肺炎链球菌引起的肺炎，小儿会出现反复发烧的情况，还可能伴有咳嗽、咳痰等症状。
感染性因素方面
病毒感染： 除了流感病毒，还有鼻病毒等也能引起小儿反复发烧。鼻病毒感染时，小儿往往会先出现鼻塞、流涕等上呼吸道卡他症状，随后出现发烧，体温可波动在38℃ - 39℃左右。细菌感染： 除了肺炎链球菌，金黄色葡萄球菌引起的化脓性感染也会让小儿反复发烧，像皮肤软组织的金黄色葡萄球菌感染，小儿局部会有红、肿、热、痛的表现，同时伴有反复发热。
非感染性因素方面
自身免疫性疾病： 比如幼年特发性关节炎，这是儿童时期常见的风湿性疾病，小儿会出现反复发烧的症状，而且体温波动较大，同时可能有关节肿胀、疼痛等表现。中暑： 在炎热的环境下，小儿体温调节中枢功能不完善，容易发生中暑，从而出现反复发烧的情况，尤其是在气温较高且小儿穿着过厚、水分补充不足时更易发生。恶性肿瘤： 虽然相对少见，但一些血液系统的恶性肿瘤，如白血病，也会导致小儿反复发烧，往往还伴有贫血、出血、肝脾淋巴结肿大等表现。