肠道息肉的成因较为复杂，一般认为可能与遗传因素、炎症刺激以及生活习惯等多方面有关。据相关研究，约20% - 30%的肠道息肉具有遗传倾向，若家族中有肠道息肉病史，亲属患病风险会相对增高。
遗传因素相关
家族性腺瘤性息肉病：这是一种常染色体显性遗传性疾病，患者体内存在特定的基因突变，会使得肠道黏膜不断长出腺瘤性息肉，通常在青少年时期就可能逐渐显现，且若不及时干预，很可能发展为肠癌。错构瘤性息肉综合征：如Peutz - Jeghers综合征，也是由遗传因素导致，患者肠道会出现错构瘤性息肉，同时口唇等部位可能有色素沉着。
炎症刺激方面
慢性肠炎影响：长期患有溃疡性结肠炎、克罗恩病等慢性肠道炎症的患者，肠道黏膜反复受到炎症刺激，就容易引发息肉。例如，溃疡性结肠炎患者病程超过10年，肠道息肉的发生率会明显升高。感染因素作用：一些肠道细菌、病毒感染若长期存在，也可能刺激肠道黏膜增生形成息肉。比如肠道幽门螺杆菌感染相关的研究中，也发现可能与肠道息肉的发生有一定关联。
生活习惯因素
饮食不均衡影响：长期高脂、高蛋白饮食，而膳食纤维摄入不足的人群，肠道蠕动相对缓慢，肠道内环境容易发生改变，增加息肉形成风险。有研究表明，每日膳食纤维摄入少于20克的人群，肠道息肉发生率比摄入充足者高出约30%。吸烟与饮酒影响：吸烟会影响肠道的正常生理功能，增加肠道息肉的发生几率；长期大量饮酒也会对肠道黏膜造成刺激，破坏肠道黏膜的屏障功能，从而促进息肉形成。