怀孕45天查出子宫肌瘤的处理方式取决于多个因素，包括子宫肌瘤的大小、生长位置以及孕妇是否继续妊娠的意愿，通常以观察为主而不建议手术。
一、子宫肌瘤是育龄女性中较为常见的良性肿瘤。在怀孕45天查出子宫肌瘤时，要通过超声来明确肌瘤的大小和生长位置。一般来说，1.如果肌瘤直径大于4厘米，或者位于宫腔内即粘膜下，那么就可能对此次妊娠产生不良影响，比如导致先兆流产或流产等情况；2.要是没有这类情况，在孕期只需定期进行超声检查，观察肌瘤大小的变化情况即可，无需特别处理。
二、子宫肌瘤在怀孕期间，由于盆腔充血、子宫血运增加以及雌激素水平上升等因素，有可能会进一步增大。如果孕期子宫肌瘤增长速度过快，可能会发生红色变性。红色变性属于良性变性，但可能引发局部炎症、坏死，进而引起机体的炎症反应，导致腹痛、发热，甚至可能引起流产。
三、所以在孕前检查发现肌瘤体积大于4厘米或是位于粘膜下时，应先进行手术处理然后再妊娠。但是对于孕前或早孕期间发现的较小子宫肌瘤，是不建议手术的，仅需在孕期定期通过超声监测其大小变化就行。
总之，怀孕早期查出子宫肌瘤，要综合多方面因素来确定处理方法，重点关注肌瘤的具体情况并做好孕期监测。