指甲凹凸不平可能由多种原因引起。比如，甲营养不良就可能导致这种情况，约有10% - 20%的人会因身体缺乏维生素、微量元素等出现指甲凹凸不平。
一、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当身体缺乏维生素A时，指甲可能会变得凹凸不平。一般来说，正常成年人每天需要摄入一定量的维生素A来维持指甲健康，缺乏时就易出现异常。如果缺乏B族维生素，也可能影响指甲的正常生长状态，导致凹凸不平。微量元素缺乏： 锌元素对指甲的健康很重要，体内锌含量不足时，约有30%左右的人会出现指甲凹凸不平的现象。铁元素缺乏也可能波及指甲，造成指甲表面不平整。
二、疾病因素
甲癣： 这是由真菌感染引起的疾病。真菌会侵袭指甲，破坏指甲的正常结构，使得指甲出现凹凸不平、变色、增厚等改变。甲癣具有一定传染性，若不及时治疗，可能会传染给其他指甲或者他人。扁平苔藓： 这是一种慢性炎症性皮肤病，当累及指甲时，约有20% - 30%的患者会出现指甲凹凸不平的情况，还可能伴有指甲变薄、纵嵴等表现。银屑病： 患有银屑病的人，约有5% - 10%会出现指甲病变，其中指甲凹凸不平是常见表现之一，同时还可能有指甲点状凹陷、甲分离等症状。
三、外界因素影响
外伤： 指甲受到外力撞击等外伤后，可能会影响指甲的生长，导致局部出现凹凸不平的情况。比如手指被重物砸到等情况，就可能使指甲生长出现异常。长期接触刺激性物质： 经常接触洗涤剂、化学溶剂等刺激性物质，会对指甲造成损伤，约有40%长期接触此类物质的人会出现指甲凹凸不平的状况。例如，经常做家务频繁接触洗洁精等的人群，指甲更容易受影响。