肚子有时疼有时不疼可能由多种原因引起。比如胃肠道功能紊乱时，约有30% - 40%的人会出现这种间歇性腹痛的情况。
一、消化系统问题
饮食因素导致： 如果短时间内吃了过多辛辣、油腻的食物，像一顿吃了大量辣椒炒肉这类重口味且不易消化的食物，就可能刺激胃肠道，引起偶尔的腹痛。一般这种情况通过调整饮食，吃些清淡易消化的食物，腹痛能逐渐缓解。胃肠道疾病： 慢性胃炎患者也可能出现肚子有时疼有时不疼的情况，这类患者胃黏膜长期受到炎症刺激，当饮食不规律或者受到外界不良因素影响时就会发作疼痛。比如本身有慢性胃炎的人，在饥饿或者进食较多刺激性食物后，就可能出现间歇性腹痛。还有十二指肠溃疡，典型症状是空腹疼，也就是有时不疼（进食前），有时疼（空腹时），这是因为胃酸分泌后刺激溃疡面导致疼痛。
二、腹部脏器问题
胆囊问题： 慢性胆囊炎也会出现肚子有时疼有时不疼的情况。胆囊炎症在进食油腻食物后容易发作，而在平时可能症状不明显。例如吃了油炸食品后，胆囊收缩排出胆汁不畅，就会引起右上腹疼痛，之后可能又缓解。泌尿系统问题： 输尿管结石也可能导致这种情况，结石在输尿管内移动时，会引起间歇性的腹部疼痛，有时疼有时不疼。比如较小的结石在输尿管内移动，刺激输尿管平滑肌，引起疼痛，当结石暂时固定时，疼痛就会缓解。
三、其他因素
腹部受凉： 腹部受到寒冷刺激时，胃肠道平滑肌会痉挛，也可能出现肚子有时疼有时不疼的情况。比如天气较冷时，没有注意腹部保暖，就可能引发这种间歇性腹痛，通过保暖措施，如热敷腹部，疼痛可能会减轻。精神心理因素： 长期精神紧张、焦虑的人，也可能出现胃肠道功能紊乱，表现为肚子有时疼有时不疼。像一些工作压力大、长期处于紧张状态的人群，由于植物神经功能紊乱，影响胃肠道的正常蠕动和消化功能，从而导致腹痛的间歇性发作。