眼睫毛下面长小水泡可能是由结膜炎、睑缘炎、单纯疱疹病毒等引起。
一、结膜炎：如果平时不注重眼部卫生，结膜就容易遭到病原菌的侵袭从而形成炎症。在这种炎症的刺激下，会导致眼部分泌物显著增多，进而可能出现眼睫毛下长小水泡的情况。
二、睑缘炎：当睑板腺遭受细菌、病毒等病原体的感染后，会使得睑板腺的分泌物变多，当这些分泌物堵塞睑板腺开口时，就会形成小水泡。
三、单纯疱疹病毒：要是感染了单纯疱疹病毒，并且病毒累及到眼睑部位，同样会致使眼睫毛下面长出小水泡。
此外，还有可能是睑板腺囊肿等因素导致的，具体情况需要到医院由专业医生进行准确判断。
总之，眼睫毛下长小水泡的原因较多，应及时就医，以便明确具体原因并采取针对性的措施。