组成成分差异
六味地黄丸主要由熟地黄、酒萸肉、山药、牡丹皮、茯苓、泽泻组成。
桂附地黄丸则是在六味地黄丸的基础上，加入了肉桂、附子（制）。
功效作用区别
六味地黄丸：具有滋阴补肾的功效，主要用于肾阴亏损，头晕耳鸣，腰膝酸软，骨蒸潮热，盗汗遗精，消渴等病症。现代研究表明，它对机体免疫功能有一定的调节作用，还能改善肾功能，延缓衰老等。例如有研究发现其对实验性糖尿病肾病有一定的保护作用，可降低尿蛋白，改善肾功能指标。
桂附地黄丸：有温补肾阳的功效，适用于肾阳不足，腰膝酸冷，肢体浮肿，小便不利或反多，痰饮喘咳，消渴等病症。它能改善肾阳虚引起的一系列症状，像对于肾阳虚导致的畏寒怕冷、手脚冰凉等有一定的改善作用，还可调节内分泌，对下丘脑-垂体-肾上腺轴功能有一定影响，从而起到温阳的效果。
适用人群差异
六味地黄丸：适用于肾阴亏虚的人群，常见于中青年人群，尤其是那些有肾阴不足表现，如易出现燥热、盗汗、腰膝酸软等情况的人。对于一些患有高血压、糖尿病、甲状腺功能亢进等疾病，中医辨证属肾阴亏损的患者也可在医生指导下使用。但对于脾胃虚弱，呕吐泄泻，腹胀便溏、咳嗽痰多者慎用。
桂附地黄丸：适用于肾阳不足的人群，多为中老年人群，常见有畏寒怕冷、小便清长、腰膝冷痛等肾阳虚表现的人。对于一些患有慢性支气管炎、哮喘、慢性肾炎、前列腺增生等疾病，中医辨证属肾阳不足的患者可考虑使用。但孕妇忌服，感冒发热病人不宜服用。
药性特点差异
六味地黄丸药性偏于滋阴，以补为主。
桂附地黄丸在滋阴的基础上有温阳的作用，药性相对偏温。