呼吸暂停综合征的治疗方法需根据病情严重程度等因素来定，一般中轻度患者可通过改变生活方式等进行干预，而重度患者可能需要手术等治疗。比如轻度的阻塞性呼吸暂停综合征，可先尝试非手术的综合治疗。
改变生活方式干预
睡眠姿势调整： 尽量采取侧卧位睡眠，这样能在一定程度上减少上气道梗阻的情况发生。有研究表明，侧卧位睡眠可使呼吸暂停的次数减少。控制体重： 对于体重超标的患者，减轻体重很关键。一般建议体重指数（BMI）控制在正常范围，BMI的计算方法是体重（千克）除以身高（米）的平方，正常范围是18.5~23.9。每减轻10%的体重，呼吸暂停低通气指数（AHI）可能会下降约20%。
无创通气治疗
持续气道正压通气（CPAP）： 这是治疗呼吸暂停综合征常用的无创通气方法。通过佩戴面罩，在睡眠时提供持续的正压气流，保持气道通畅。一般需要根据患者的具体情况调整压力参数，多数患者经过合适压力的CPAP治疗后，症状能明显改善，呼吸暂停和低通气事件会大幅减少。双水平气道正压通气（BiPAP）： 相较于CPAP，BiPAP在吸气和呼气时提供不同的压力，对于一些有二氧化碳潴留等情况的患者可能更适用，能更有效地改善通气功能。
手术治疗情况
腺样体或扁桃体切除： 如果是儿童呼吸暂停综合征，且明确是因腺样体或扁桃体肥大导致，可考虑手术切除。比如儿童腺样体肥大引起的阻塞性睡眠呼吸暂停，切除后多数患儿的症状能得到缓解。腭咽成形术： 对于成人阻塞性呼吸暂停综合征，腭咽成形术是常见的手术方式。通过缩小咽部组织，扩大气道，改善呼吸状况。但手术有一定的适应证和禁忌证，需要医生评估患者的具体病情后决定是否适合手术。