肛门上火疼痛时，用药需在医生指导下依据不同病因来选择相应药物，主要涵盖肛周感染性疾病以及非感染性疾病，具体如下：
一、肛周感染性疾病：
1.肛周脓肿：会呈现出肛周上火疼痛、局部红肿等炎性表现。肛周脓肿形成后需进行穿刺抽脓，对脓液加以培养以鉴定致病菌，再开展药敏实验来确定合适的抗生素。针对大肠杆菌可选用如头孢克肟片、阿莫西林等；针对金黄色葡萄球菌可选用喹诺酮类药物如盐酸左氧氟沙星片、盐酸莫西沙星片等；针对链球菌，通常对磺胺类如磺胺嘧啶等以及大环内酯类如红霉素等较为敏感。
2.肛周湿疹：这也是肛周常见的感染性疾病，有肛周上火疼痛、瘙痒、急性期局部红肿等症状。在治疗上使用糖皮质激素乳剂与抗炎药物，如在专业医师指导下使用氢化可的松、地塞米松、哈西奈德等糖皮质激素乳膏，并合用阿莫西林、头孢他啶、头孢唑林钠等抗生素。此外，每天可使用干净毛巾擦拭肛周，保持肛周清洁，日常饮食多吃水果蔬菜等。
二、肛周非感染性疾病：
1.肛裂：可表现为肛周上火疼痛、局部红肿、渗出等症状。在治疗方面，如果是症状较轻或初发的肛裂，可先考虑保守治疗，包括食用易消化清淡饮食、每天定时排便，便秘时可服用番泻叶或使用开塞露肛塞；还可采用1:5000浓度的高锰酸钾温水坐浴等。若是症状较重或长期不愈则可考虑手术治疗，术式如肛裂切除术、肛管内括约肌切断术等。
2.痔疮：还有一些其他肛周非感染性常见疾病如痔疮，在急性期可能有疼痛、异物感、肛门口发红、肛门上火等表现，其保守治疗为调整排便习惯和饮食结构、高锰酸钾坐浴、痔疮栓纳肛、红霉素软膏等。保守治疗无效者可行胶圈套扎术、硬化剂黏膜注射术或吻合器PPH痔切除术等手术治疗。
总结概况提示：肛门上火疼痛的用药选择要根据具体病因，包括肛周感染性疾病的肛周脓肿、肛周湿疹，以及肛周非感染性疾病的肛裂、痔疮等，不同情况有不同的治疗方法和药物，且均需在医生指导下进行。