男性生殖器疱疹的治疗包含一般治疗、系统用药以及外用药物。
一、一般治疗：要注重休息，避免饮酒、劳累以及过度的性生活。当出现临床症状，比如疼痛或是生殖器处有簇集、散在的小水疱时，就必须避免性生活。
二、系统用药：
1.初发者可依据医嘱使用阿昔洛韦等抗病毒药物；
2.对于复发型可采用间歇疗法，也就是在出现前驱症状之前就开始进行治疗。
三、外用药物：
1.可选用以抗病毒、收敛、干燥以及防止继发感染为主的药物，比如按照医嘱使用3%阿昔洛韦软膏或炉甘石洗剂；
2.当继发感染时，可依据医嘱应用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏；
3.要是有合并龈口炎，则应保持口腔清洁，外用口腔含漱液。
总之，以上所有用药都需要在医生的指导下进行，而且出现男性生殖器疱疹的患者应当及时就诊，通过积极治疗并改善生活方式，有希望使疱疹不再复发。