一、脊柱侧弯
脊柱侧弯是导致肩膀一边高一边低较常见的原因，是脊柱的冠状位、矢状位或轴位发生序列异常，表现为脊柱向侧方弯曲。其成因包括生长发育过程中的脊柱生长不平衡、遗传因素、神经肌肉疾病（如脑瘫等）、姿势不良等，青少年群体中较为多发，与骨骼发育阶段及长期不良姿势等因素相关。
二、先天性脊柱发育异常
如半椎体、蝴蝶椎等先天性脊柱结构异常，会使脊柱生长不对称，进而导致肩膀高低不一。这是由于胚胎发育时期脊柱结构形成出现偏差，从胎儿期就存在脊柱形态的异常，出生后随生长发育逐渐显现出肩膀不等高的表现。
三、肌肉骨骼系统疾病
1.肌肉萎缩：一侧肩部或背部肌肉萎缩会引起肩膀高低差异，常见于神经损伤、长期废用等情况，神经损伤会导致对应肌肉失去神经支配而萎缩，长期废用则因缺乏运动使肌肉退化，从而造成两侧肩膀不平衡。
2.斜颈：包括先天性肌性斜颈和痉挛性斜颈。先天性肌性斜颈多因胎儿在子宫内位置异常等导致胸锁乳突肌纤维化、短缩，出生后表现为头偏向一侧，进而引起肩膀高低不一；痉挛性斜颈则是颈部肌肉不自主收缩导致头部及颈部扭曲、倾斜，也会伴随肩膀位置异常。
四、神经肌肉疾病
像脑瘫患儿，由于中枢神经系统损伤，会出现肌肉张力异常、运动功能障碍，导致肌肉力量不平衡，可表现为肩膀一边高一边低，同时还常伴有运动发育迟缓、姿势异常等其他表现，其成因与脑部发育异常、分娩损伤等相关。
五、姿势性问题
长期不良姿势，如驼背、单肩背包等，可在短期内引起肩膀一边高一边低，但若长期未纠正，可能发展为病理性情况。例如长期单肩背包会使一侧肩部肌肉长期处于紧张状态，另一侧相对松弛，久而久之造成脊柱及肩部的力学平衡失调，引发肩膀高低差异。