细菌性结膜炎的治疗主要包括局部用药和注意日常护理等方面。一般来说，通过规范治疗，多数患者在数天内可改善症状。
局部药物治疗
抗生素眼药水：常用的有左氧氟沙星滴眼液，它对多种引起细菌性结膜炎的细菌有抑制作用。还有妥布霉素滴眼液，也能有效对抗导致结膜炎的细菌。这些眼药水需根据病情严重程度，遵医嘱规律使用，一般每天使用数次。眼膏辅助：像红霉素眼膏，在夜间睡觉前涂抹，能在眼部保持较长时间的药物浓度，帮助持续对抗细菌。
日常护理要点
眼部清洁：要用干净的毛巾或棉签蘸取生理盐水轻轻擦拭眼睛，清除眼部分泌物，每天可进行数次。但注意擦拭时要从眼内眦向外眦方向轻柔擦拭，避免交叉感染。避免刺激：患病期间要避免佩戴隐形眼镜，同时要减少接触强光、粉尘等刺激因素，让眼睛有较好的恢复环境。
特殊情况注意
儿童患者：儿童患细菌性结膜炎时，选择眼药水要更加谨慎，应在医生指导下选用适合儿童的低刺激性药物。比如儿童可用的妥布霉素滴眼液相对较为安全，但也需严格按照医嘱使用。免疫力低下者：本身有糖尿病等免疫力低下疾病的患者，患细菌性结膜炎后要积极控制基础疾病，同时在治疗结膜炎时可能需要加强抗感染治疗，并且要密切观察病情变化，因为这类人群病情可能发展较快。