口腔溃疡的诱因较多，比如约20%~30%的人有遗传倾向，若家族中有口腔溃疡患者，自身患病几率会相对高些。
局部创伤因素
口腔内机械刺激： 牙齿残根、残冠或者不合适的假牙等，会持续摩擦口腔黏膜，一般在接触刺激后1~2周内就可能引发口腔溃疡。比如长期存在的锐利牙尖，就容易反复摩擦对应部位的黏膜。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬到舌头、颊部等部位，短时间内（通常1-2天）就可能形成口腔溃疡。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 当体内缺乏维生素B12、叶酸等时易引发口腔溃疡。有研究显示，约30%的复发性口腔溃疡患者存在维生素B2水平偏低的情况，一般补充相应维生素后，溃疡情况会有所改善，但需要持续补充1-2周观察效果。微量元素缺乏： 如锌、铁等微量元素缺乏也和口腔溃疡有关。比如缺锌时，会影响细胞的正常代谢，导致黏膜修复能力下降，从而容易长口腔溃疡。
免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，会错误地攻击自身口腔黏膜组织，引发口腔溃疡。像患有白塞病时，口腔溃疡只是其中一个症状，还会伴有眼部、生殖器等部位的病变，这种情况口腔溃疡会反复发作，可持续数月甚至数年。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如感冒、过度疲劳后，就容易受到病原体侵袭，进而引发口腔溃疡，一般免疫力恢复后，溃疡有自愈的可能，但可能需要1-2周时间。