肺脓肿通常是由多种因素引起的，主要是病原体感染导致，其中细菌感染较为常见，比如金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌等都可能引发肺脓肿，有数据显示约80%的肺脓肿与厌氧菌感染有关。
病原体感染因素
细菌感染： 金黄色葡萄球菌是常见的致病菌之一，它可通过呼吸道进入肺部，在肺部大量繁殖，破坏肺组织，从而引发肺脓肿。肺炎克雷伯杆菌引起的肺脓肿也不少见，这种细菌感染后会导致肺部出现化脓性炎症。厌氧菌感染： 口腔中的厌氧菌容易在人体抵抗力下降时，随分泌物被吸入肺部，进而引发肺脓肿。比如长期吸烟的人，呼吸道防御功能可能受到影响，就更容易让厌氧菌有可乘之机感染肺部。
气道阻塞因素
异物阻塞： 如果气管内进入异物，比如小的食物颗粒、玩具小零件等，会导致气道部分或完全阻塞，使远端肺部的分泌物引流不畅，细菌容易在局部繁殖，从而引发肺脓肿。例如儿童在进食时打闹，就有可能将食物呛入气道导致阻塞。肿瘤阻塞： 肺部的肿瘤会阻塞支气管，使痰液排出受阻，痰液在肺内积聚，为细菌滋生创造了条件，长期下去就可能引发肺脓肿。比如支气管肺癌患者，随着肿瘤的生长，可能会出现肺脓肿的并发症。
免疫力低下因素
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的免疫力会受到影响，更容易受到病原体的侵袭。据统计，糖尿病患者发生肺脓肿的几率比正常人要高，因为高血糖环境有利于细菌的生长繁殖。艾滋病患者： 艾滋病患者的免疫系统严重受损，抵抗力极低，很容易感染各种病原体，包括能引起肺脓肿的细菌等，而且病情往往比较严重，治疗也相对困难。