灰指甲主要是由皮肤癣菌感染引起的，据统计，约95%的灰指甲是由皮肤癣菌导致的。
感染途径方面
直接接触感染：与患有灰指甲的人直接接触，比如一起握手、共用毛巾等，就有可能被感染。要是家里有人得了灰指甲，和他密切接触就增加了被传染的风险。间接接触感染：在公共浴池、游泳池、足疗店等公共场所，接触到被真菌污染的物品，像拖鞋、脚盆、毛巾等，也容易感染灰指甲。比如在公共泳池里，要是泳池的卫生条件不好，真菌就可能存活在水里，接触后就可能引发感染。
自身因素影响
免疫力低下：当人体免疫力比较低的时候，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人，更容易受到真菌的侵袭，患上灰指甲的几率会比正常人高很多。像糖尿病患者，由于血糖控制不好，身体的抵抗力下降，就更易感染真菌引发灰指甲。足部多汗：脚部容易出汗的人，脚部环境比较潮湿，这种潮湿温暖的环境很适合真菌生长繁殖，从而增加了患灰指甲的可能性。比如爱运动的人，运动后脚部出汗多，如果不及时更换干爽的袜子和鞋子，就容易滋生真菌。指甲损伤：指甲受到外伤，比如被重物砸到、修剪指甲过度等，会使指甲的屏障功能受损，真菌就容易侵入指甲引发感染。例如经常美甲的人，频繁的美甲操作可能会损伤指甲，增加感染灰指甲的风险。