治疗咽炎并没有绝对最好的药，需根据不同类型和病情选择。一般来说，急性咽炎多由病毒或细菌感染引起，可使用一些对症药物。比如病毒感染引起的急性咽炎，有时可使用干扰素等，但常用的是对症缓解症状的药物，如含漱液，复方硼砂含漱液可用于清洁口腔、杀菌消炎，一般每天含漱数次。
病毒性咽炎可用药物
局部抗病毒药物： 更昔洛韦凝胶等可用于局部涂抹，有一定抗病毒作用，但需在医生指导下使用。一般局部用药针对症状较轻的病毒性咽炎。对症缓解药物： 对于咽痛较明显的病毒性咽炎患者，还可使用含片，如度米芬含片，能抑制和杀灭细菌，减轻咽部炎症反应，缓解疼痛，但儿童使用需谨慎，避免误吞。
细菌性咽炎可用药物
抗生素： 若为细菌感染引起的咽炎，常用青霉素类抗生素，如青霉素V钾片，它能抑制细菌细胞壁合成，起到杀菌作用。但使用前需确认患者无青霉素过敏史，有青霉素过敏史者不能使用。局部抗菌药物： 复方氯己定含漱液也可用于细菌性咽炎，能有效杀灭口腔内的细菌，减轻咽部炎症，一般每天含漱2 - 3次。
慢性咽炎可用药物
中成药： 咽炎片是常见的治疗慢性咽炎的中成药，它由玄参、麦冬、桔梗等多种中药组成，有养阴润肺、清热解毒、清利咽喉、镇咳止痒的作用，一般按说明书服用即可，但糖尿病患者需慎用。局部用药： 西瓜霜润喉片也可用于慢性咽炎，能起到消肿止痛、清利咽喉的作用，可含服，缓解咽部不适，但孕妇慎用。