孩子已发烧两天，且反复烧至39℃，这时要考虑发热原因，包括感染性发热，如细菌、病毒、支原体等感染引起；还有非感染性发热，像川崎病、血液系统疾病等也会让小孩发热。对此，需找出具体发热原因，并依据不同原因制定不同处理办法：
一、可以让孩子多喝水，若孩子能配合，可采取物理降温措施，如头部冷敷、温水擦浴以及洗温水澡等；
1.多喝水有助于补充水分，防止脱水。
2.头部冷敷能帮助降低头部温度，缓解不适。
3.温水擦浴可利用水分蒸发带走热量。
4.洗温水澡能较为全面地给身体降温。
二、若孩子有明显不适症状，可选择口服退热药物，目前推荐的是布洛芬或对乙酰氨基酚，这两种药物相对安全，对大多数孩子的退热效果也较好；
1.布洛芬有较好的解热镇痛作用。
2.对乙酰氨基酚也常用于儿童退热。
三、建议在口服退热药物与进行物理降温的同时，要及时到医院就诊，必要时完善血常规等相关检查，以免耽误病情和治疗；
1.到医院就诊能得到更专业的诊断和指导。
2.血常规等检查有助于明确感染类型等情况。
四、要是孩子发热持续不退，或者出现嗜睡、呼吸费力、惊厥等表现，必须立刻到医院就诊，以免延误病情。
总之，孩子发烧时要重视，及时采取合适措施并根据情况就医，以保障孩子健康。