脑膜炎后遗症的症状较多，常见的有认知功能障碍，约30%的脑膜炎患者可能出现不同程度的记忆力减退、注意力不集中等情况。
神经系统功能障碍
运动功能方面：部分患者会出现肢体运动障碍，表现为单侧或双侧肢体无力，严重的可能无法正常行走。比如有的患者会走路不稳，上下楼梯困难。还有些患者会有肌张力异常，出现肢体僵硬或者过于松软的情况。癫痫发作：约20% - 30%的脑膜炎患者在后遗症期会发生癫痫。癫痫发作形式多样，有全身强直 - 阵挛发作，表现为突然意识丧失、四肢抽搐、口吐白沫等；也有部分患者是局部性发作，如某一侧肢体的抽搐等。
精神行为异常
情感变化：可能出现情绪不稳定，容易烦躁、焦虑或者抑郁。有的患者原本性格开朗，患病后变得沉默寡言、情绪低落。认知与行为改变：存在学习困难，对于新的知识接受能力下降。行为上可能变得异常，比如出现重复刻板的行为等。部分患者还可能出现人格改变，与患病前相比，性格、行为模式有较大差异。
其他系统相关症状
视力问题：部分脑膜炎后遗症患者会有视力方面的问题，可能出现视力下降、视野缺损等情况。例如看东西模糊，或者眼睛能看到的范围变小。听力障碍：约10% - 15%的患者会出现不同程度的听力下降，严重的可能导致听力丧失，影响正常的交流沟通。