脑膜炎后遗症的症状较多，常见的有认知障碍，约有30%左右的脑膜炎患者会出现不同程度的认知障碍，表现为记忆力减退、注意力不集中、学习能力下降等。
神经系统方面的症状
运动功能障碍：部分患者会出现肢体运动异常，比如一侧肢体无力，走路时可能会跛行；严重的还可能出现肢体瘫痪，影响正常的肢体活动。有的患者会有肌张力异常，表现为肢体僵硬或者过于松软。癫痫发作：大约10% - 20%的脑膜炎患者会遗留癫痫后遗症。癫痫发作形式多样，可能是全身性大发作，表现为突然意识丧失、四肢抽搐、口吐白沫；也可能是部分性发作，如某一侧肢体的抽搐、感觉异常等。
精神心理方面的症状
情绪异常：患者可能出现情绪低落、抑郁，表现为对以往感兴趣的事情提不起兴趣，整天闷闷不乐，严重的可能有自杀倾向；也有的患者会出现情绪易激惹，一点小事就容易发怒。智力减退：轻度的智力减退可能表现为学习新事物困难，对周围环境的理解和应对能力下降；重度的智力减退会影响日常生活自理能力，比如不认识家人、不能正确表达自己的需求等。
其他方面的症状
头痛：很多脑膜炎后遗症患者会有长期头痛的情况，头痛程度轻重不一，有的是间歇性头痛，有的是持续性隐痛，在劳累、情绪激动等情况下可能会加重。视力听力障碍：部分患者会出现视力下降，可能是视物模糊、视野缺损等；还有些患者会有听力减退，表现为对声音的敏感度降低，听不清别人说话等。