胃功能紊乱的症状较多，常见的有消化不良相关症状，比如约50%的胃功能紊乱患者会出现餐后饱胀感，感觉吃一点东西就肚子胀，长时间不消化。还会有上腹痛，疼痛程度不一，有的是隐痛，有的是钝痛，没有明确的规律。
胃肠道相关症状
腹痛腹胀：多数患者会有腹部疼痛，疼痛部位不固定，可能在上腹部、脐周等，同时伴有腹胀，尤其是进食后腹胀感更明显。比如吃了一顿普通餐食后，腹胀能持续数小时甚至更久。恶心呕吐：部分人会出现恶心，严重时可能伴随呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般为未消化的食物。
全身伴随症状
失眠焦虑：胃功能紊乱可能会影响神经系统，约30% - 40%的患者会出现失眠情况，难以入睡或睡眠浅、易醒。同时还可能伴有焦虑情绪，总觉得心情烦躁、不安，影响日常生活和工作。疲劳乏力：患者会感觉浑身没力气，即使休息后也不能缓解，日常活动容易感到疲惫，影响体力和精力。
其他特殊表现
食欲改变：有的患者食欲减退，不想吃东西，食量明显减少；而有的患者则可能出现食欲亢进，总是觉得饿，但吃了又不舒服。比如食欲减退的患者可能一天的进食量比正常减少一半以上。排便异常：部分患者会出现排便习惯改变，有的便秘，大便干结、排便困难，几天才一次；有的则腹泻，大便稀溏，次数增多，一天可能排便3 - 5次甚至更多。