胃功能紊乱的症状较多，常见的有消化不良相关症状，约有50%左右的胃功能紊乱患者会出现餐后饱胀感，表现为进食少量食物就觉得肚子饱胀，长时间不缓解。
胃肠道不适症状
腹痛： 多数患者会有腹痛表现，疼痛部位不固定，一般为隐痛或胀痛，疼痛程度轻重不一，有的患者疼痛会在进食后加重，但也有的在进食后缓解。腹胀： 肚子老是感觉胀满，尤其在进食后腹胀感更明显，有时会持续数小时甚至一整天，影响食欲。
其他系统伴随症状
精神症状： 部分患者会出现精神方面的表现，约有30% - 40%的胃功能紊乱患者会有焦虑、抑郁、失眠等情况。比如焦虑的患者会总是担心自己的病情，情绪容易紧张不安；失眠的患者难以入睡或者睡眠浅、易醒。全身症状： 可能会有全身乏力的感觉，有的患者还会出现头痛、头昏等症状，但一般检查身体没有明显的器质性病变支持这些全身症状是由其他疾病引起的。
与饮食相关的症状
食欲变化： 有的患者食欲减退，不想吃东西，食量明显减少；而有的患者可能会出现食欲异常亢进，总是感觉饿，不停地想吃东西，但进食后又会有不适。对食物的反应： 对某些特定食物敏感，比如吃了油腻食物、辛辣食物后容易出现不适加重，像吃了油腻食物可能会导致腹胀、腹痛症状加重，吃了辛辣食物可能刺激胃肠道，引起腹痛、腹泻等表现。