鼻窦炎和过敏性鼻炎可以从症状表现、发病时间、伴随症状来区分。一般来说，鼻窦炎的鼻塞、流涕症状持续超过12周可能要考虑，而过敏性鼻炎往往有明显的过敏诱因。
症状表现差异
鼻塞情况：鼻窦炎引起的鼻塞通常比较严重，且持续时间较长，可能单侧或双侧鼻塞；过敏性鼻炎的鼻塞程度相对较轻，呈间歇性，接触过敏原时易发作。流涕特点：鼻窦炎流涕多为脓性，颜色发黄或发绿；过敏性鼻炎流涕一般是清水样，量较多。
发病时间区别
鼻窦炎：急性鼻窦炎病程通常在12周以内，慢性鼻窦炎则超过12周。过敏性鼻炎：多呈季节性发作，比如春季花粉季、秋季某些植物花粉传播时容易发病，也有常年性的，与室内尘螨、霉菌等过敏原长期接触有关。
伴随症状不同
鼻窦炎：常伴有头痛，一般有一定的时间规律，比如晨起后头痛明显，下午逐渐减轻；还可能有嗅觉减退的情况。过敏性鼻炎：主要伴随症状是打喷嚏，次数较多，每天数次阵发性发作，还可能伴有眼睛痒、耳朵痒等过敏相关症状。