一般来说，蹲完厕所起身时膝盖痛，可能与以下因素相关：
一、髌股关节炎：
1.膝关节的髌骨与股骨间存在髌骨关节。
2.当发生髌股关节炎时，会致使滑膜组织充血、肿胀，进而引起关节肿胀与疼痛。
二、半月板损伤：
1.若半月板后角出现损伤。
2.那么在蹲厕所时，半月板后角受到挤压就可能导致起身时膝盖疼痛。
三、骨关节炎：
1.骨关节炎的致病原因，多考虑和创伤、炎症、年龄、感染等有关。
2.通常在受凉、劳累或受外力作用时，膝盖可能出现僵硬、疼痛的情况，且活动时疼痛会加重，所以蹲厕所起身时是有可能出现膝盖痛现象的。
总之，具体原因需要患者尽快就医，听从医生的诊疗意见，用药也需严格遵循医嘱。