口腔溃疡的治疗药物需根据具体情况选择，一般来说，局部用药较为常用。例如，西瓜霜喷剂是常见的局部用药，能在一定程度上缓解口腔溃疡的疼痛等症状，通常几元到十几元不等。
局部外用药
口腔溃疡散：主要成分有青黛、白矾、冰片等，具有清热敛疮的作用，可直接撒于口腔溃疡处，能减轻疼痛，促进溃疡面愈合，一般使用时每天可撒敷数次。重组人表皮生长因子凝胶：能促进皮肤与黏膜创面组织修复过程中的DNA、RNA和羟脯氨酸的合成，加速创面肉芽组织的生成和上皮细胞的增殖，从而缩短创面的愈合时间，使用时取适量凝胶涂抹于溃疡表面，每日使用1 - 2次。
口服药物
维生素类药物：如维生素B₂，当人体缺乏维生素B₂时容易引发口腔溃疡，适当补充维生素B₂可能有助于预防和改善口腔溃疡。一般成年人每天的推荐摄入量是1.2 - 1.5毫克，可通过服用维生素B₂片来补充，但需注意按剂量服用。免疫调节类药物：对于反复发生且较为严重的口腔溃疡，可能会用到免疫调节类药物，如转移因子口服液。它可以调节机体免疫功能，增强抵抗力，但儿童服用时需在医生指导下，根据体重等情况确定用量。
特殊人群用药注意
儿童：儿童出现口腔溃疡时，使用局部外用药要格外小心，避免误吞。比如使用口腔溃疡散时，要防止儿童吸入或吞咽过多。对于口服药物，像维生素B₂，儿童服用剂量需严格按照儿童的年龄和体重来调整，一般会低于成人剂量。孕妇：孕妇出现口腔溃疡时，局部用药相对更安全，如可以谨慎使用重组人表皮生长因子凝胶等。而口服药物则需非常谨慎，必须在医生的评估下使用，因为很多口服药物可能会对胎儿产生影响，医生会权衡利弊后选择合适的治疗方案。