新冠性肺炎是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）引起的。该病毒最初被认为可能来源于野生动物，2020年1月，中国科学家通过全基因组测序等技术手段，确定新冠病毒与蝙蝠身上的某种冠状病毒亲缘关系最近，初步判定其自然宿主可能是蝙蝠。
病毒的动物溯源情况
蝙蝠携带的潜在关联： 蝙蝠是多种冠状病毒的自然宿主，SARS-CoV-2与蝙蝠中发现的冠状病毒有较高的基因相似性。研究发现，蝙蝠体内的某些冠状病毒在结构和功能上与SARS-CoV-2有类似之处，这为新冠病毒源于蝙蝠提供了重要的分子生物学依据。中间宿主的推测： 有科学推测认为，可能存在中间宿主将病毒从蝙蝠传播给人类。例如，有研究指出穿山甲体内的冠状病毒与SARS-CoV-2的基因序列相似度较高，提示穿山甲有可能在新冠病毒从蝙蝠向人类传播过程中起到中间宿主的作用，但这一推测还需要更多的研究来进一步证实。
病毒的人际传播途径
飞沫传播： 当新冠病毒感染者咳嗽、打喷嚏、说话时，会产生含有病毒的飞沫，这些飞沫在空气中悬浮一段时间，其他人吸入后就有可能感染新冠病毒。一般来说，飞沫传播的距离通常在1 - 2米左右，但在密闭空间等情况下，传播范围可能会更广。接触传播： 病毒可以通过接触被污染的物体表面，然后再接触自己的口、鼻、眼等黏膜部位而感染。比如，手触摸了被病毒污染的门把手、电梯按钮等物体表面后，没有及时洗手就去揉眼睛或摸嘴巴，就容易被感染。
病毒的发现与确认过程
早期病例发现： 2019年12月，中国武汉陆续发现多例不明原因的肺炎病例，这些病例引起了相关部门的高度重视。医护人员通过对患者的临床表现、影像学检查以及实验室检测等多方面进行综合分析。病毒基因测序与鉴定： 科研人员对患者样本进行病毒基因测序等工作，通过与已知病毒基因序列的比对，逐步确定了引起这些肺炎的病原体是一种新型的冠状病毒，即严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2），从而明确了新冠性肺炎是由该病毒引发的。