肛门直肠周围脓肿的治疗主要包括非手术治疗和手术治疗。一般来说，多数患者需要通过手术来根治，而非手术治疗多用于病情较轻的情况。
非手术治疗方式
抗生素治疗：
适用情况： 对于症状较轻、脓肿较小的患者，可先尝试抗生素治疗。通常会根据脓液培养和药敏试验结果选择敏感抗生素，一般需要连续使用抗生素1 - 2周左右，通过使用抗生素来控制感染，缓解炎症症状。不过，单纯依靠抗生素往往难以彻底治愈，多数情况下还需要结合手术。药物举例： 常用的有头孢类抗生素，如头孢曲松钠等，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。
温水坐浴：
操作方法： 患者可每天进行1 - 2次温水坐浴，水温一般控制在40℃ - 50℃左右，每次坐浴时间约15 - 20分钟。通过温水坐浴可以改善局部血液循环，促进炎症的吸收，缓解疼痛等不适症状。但温水坐浴只是辅助治疗手段，不能替代手术等主要治疗方式。
手术治疗方法
脓肿切开引流术：
适用阶段： 这是治疗肛门直肠周围脓肿最常用的手术方法，适用于脓肿形成的患者。手术时会在脓肿波动最明显的部位切开，将脓液彻底引流出来。一般术后需要定期换药，促进创面愈合，通常需要1 - 2个月左右创面才能完全愈合。该手术能迅速缓解患者的疼痛等症状，但有复发的可能。术后注意： 术后要注意保持肛周清洁，按时换药，避免创面感染。
一次性根治术：
适用情况： 对于某些位置较复杂、肛瘘内口明确的肛门直肠周围脓肿患者，可以考虑一次性根治术。这种手术在切开脓肿引流的同时，能够找到内口并处理，避免了二次手术的痛苦。不过，该手术对医生的技术要求较高，需要准确找到内口才能保证手术效果。一般术后恢复时间相对切开引流术会短一些，但也需要患者积极配合术后护理。肛门直肠周围脓肿一旦确诊，应及时根据病情选择合适的治疗方法，早期规范治疗有助于患者更好地康复。