治口腔溃疡的药有很多种，常见的有局部用药和全身用药等。一般来说，局部用药能较快缓解症状，比如西瓜霜喷剂，通常喷后几分钟就能起到一定的止痛、促进愈合作用。
局部外用药物
口腔溃疡散： 它是一种常见的局部药，主要成分有青黛、白矾、冰片等，具有清热敛疮的作用。使用时取适量药粉涂于溃疡处，一般每天可以涂2 - 3次。但要注意，对药物成分过敏者禁用。氯己定含漱液： 这是一种抗菌类含漱液，能减少口腔内的细菌，抑制细菌繁殖，从而促进溃疡愈合。使用时取10 - 15毫升含漱液，在口腔内含漱1 - 2分钟后吐出，每天可以含漱3 - 5次。不过，长期使用可能会使口腔黏膜着色，所以不建议长期使用。
全身用药
维生素类药物： 比如维生素B2，当人体缺乏维生素B2时容易引发口腔溃疡，补充维生素B2可以从一定程度上预防和治疗口腔溃疡。一般成人每天补充量在5 - 10毫克，但要注意不能过量服用，过量可能会出现一些不良反应。免疫调节剂： 对于一些反复发生口腔溃疡且与免疫因素相关的患者，可能会用到免疫调节剂，如转移因子口服溶液等。转移因子口服溶液可以调节机体免疫功能，但孕妇和哺乳期妇女要慎用，需要在医生的指导下使用。
中药类药物
牛黄解毒片： 具有清热解毒的功效，对于因上火引起的口腔溃疡有一定的治疗作用。一般成人一次服用3片，一天服用2 - 3次。但是，孕妇禁用牛黄解毒片，而且长期大量服用可能会引起不良反应，所以不能自行长期服用。康复新液： 它可以通利血脉，养阴生肌。内服时，一次10毫升，一天3次；外用时，用医用纱布浸透药液后敷于患处。不过，对康复新液过敏者禁用，使用时要注意遵循正确的用法用量。