卵巢囊肿患者出现3个月没来月经，可能是由卵巢囊肿本身引起，也可能是怀孕、宫腔粘连等其他因素所致。患者应及时就医，明确原因后采取相应处理措施。
一、卵巢囊肿：
1.一般情况：较小的卵巢囊肿通常无明显症状，但若囊肿体积逐渐增大，可能出现下腹部疼痛、腰痛、性交疼痛等表现，巨大囊肿还可能导致月经失调，进而出现3个月不来月经的情况。
2.治疗建议：对于卵巢囊肿大于5cm的患者，可进行囊肿剔除手术或患侧卵巢切除手术治疗。
二、怀孕：
1.原因分析：若卵巢囊肿患者有正常性生活且未避孕，可能会怀孕，怀孕后子宫内膜不再有周期性变化，就会出现闭经，此时与卵巢囊肿无关。
2.应对措施：如果打算继续妊娠，可前往医院进行健康检查；如果打算终止妊娠，则需进行相关实验室检查后再决定终止妊娠的方式。
三、宫腔粘连：
1.原因分析：若卵巢囊肿患者此前有宫腔操作史（如人工流产等），导致子宫内膜损伤，从而引起宫腔粘连，也会有3个月不来月经的情况。
2.治疗建议：可在宫腔镜下将粘连组织分离开，同时放置节育环预防再次粘连，并遵医嘱应用戊酸雌二醇片促进子宫内膜生长，使月经恢复正常。
总之，当卵巢囊肿患者出现长时间不来月经时，需要综合考虑多种因素，及时明确原因以便采取合适的处理方法。