灰指甲是由皮肤癣菌等真菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，治疗灰指甲的药物主要有外用药物和口服药物。一般来说，外用抗真菌药物疗程较长，可能需要数月，而口服抗真菌药物相对见效快些，但要注意其可能存在的肝损伤风险等。
外用抗真菌药物
阿莫罗芬搽剂：它是局部外用的抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用。每周使用1 - 2次即可，一般连续使用几个月能取得一定效果。不过，使用时要注意指甲周围皮肤的清洁，且对阿莫罗芬过敏者禁用。环吡酮胺乳膏：局部涂抹后，能渗入甲床发挥抗真菌功效。可以直接涂抹在病甲及周围皮肤，一天使用1 - 2次。但使用过程中若出现局部皮肤刺激症状，如红肿、瘙痒加剧等，应停止使用。
口服抗真菌药物
伊曲康唑：它是一种合成的三氮唑类广谱抗真菌药，采用冲击疗法，即每月服用一周，连续服用几个月。它能干扰真菌细胞色素P450的活性，影响真菌细胞膜合成。不过，有严重肝病患者禁用，在用药前和用药过程中需要监测肝功能。特比萘芬：是一种丙烯胺类抗真菌药物，能选择性抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥杀菌作用。一般每天口服一次，疗程通常需要数月，同样，肝功能不全者要慎用，用药期间需关注肝功能情况。
其他辅助治疗
手术拔甲：对于单发的灰指甲，可考虑手术拔甲。但手术创伤相对较大，术后恢复需要一定时间，而且可能会有疼痛等不适，同时术后也存在复发的可能。削除病甲：在局部麻醉下，使用工具将病甲削除，然后再配合外用或口服抗真菌药物治疗。这种方法能直接去除病甲组织，让药物更好地发挥作用，但操作时要注意避免损伤甲床周围正常组织。