月经干净第二天同房后出血，可能是以下原因引起：
1.子宫内膜未完全修复：月经刚结束时，子宫内膜还未完全修复，此时同房可能导致尚未脱落的子宫内膜再次脱落，引起出血。
2.妇科疾病：如阴道炎、宫颈炎、宫颈息肉、子宫内膜炎、子宫肌瘤等，都可能导致同房后出血。这些疾病可能与第一次同房无关，也可能是由于炎症等原因引起。
3.激素水平变化：在月经周期中，激素水平会发生变化，有时可能导致子宫内膜不稳定，容易出血。
4.其他因素：如性交过于激烈、使用某些药物（如避孕药）等，也可能导致同房后出血。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，如妇科检查、B超等，以确定具体原因。同时，需要注意以下几点：
1.保持个人卫生，避免感染。
2.暂时避免同房，以免加重病情或引起其他并发症。
3.遵循医生的建议进行治疗，如使用药物、手术等。
4.定期复查，以确保病情得到控制和治愈。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，如果对出血情况有疑虑或担忧，应及时咨询医生的意见。此外，定期进行妇科检查也是预防和早期发现妇科疾病的重要措施。