经常长口腔溃疡的原因有多种。一般来说，免疫力低下是常见因素之一，比如一些人身体免疫力较差时，就容易频繁出现口腔溃疡，有研究显示约30% - 40%的口腔溃疡患者存在免疫功能紊乱情况。
局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就可能形成创伤性口腔溃疡，这种情况在进食过快、说话时不注意等情况下容易发生。牙齿刺激： 不合适的假牙、锐利的牙尖等会持续摩擦口腔黏膜，也会导致口腔溃疡反复出现，尤其是长期佩戴不合适假牙的人群更易受影响。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B2、维生素B12等时，就容易长口腔溃疡。例如，长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，很可能缺乏这些维生素从而引发口腔溃疡，有数据表明约20%的口腔溃疡患者存在维生素B族缺乏现象。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种代谢活动，缺乏锌时会影响伤口愈合等，进而容易导致口腔溃疡频繁发生。
精神因素影响
压力过大： 现代人生活节奏快，长期处于高压力状态下，会影响神经系统调节，导致内分泌失调，从而增加口腔溃疡的发生几率。比如一些学生备考期间、上班族工作压力大时，口腔溃疡就容易频繁出现。情绪波动： 长期处于焦虑、紧张、抑郁等不良情绪中，也会干扰身体的正常生理功能，使得口腔溃疡反复长。比如情绪低落的人，口腔溃疡复发的频率可能比情绪稳定的人要高些。