胎儿停育的原因较多，其中染色体异常是常见因素之一，约占50%~60%的早期胎儿停育。
染色体因素：
父母染色体异常： 如果父母双方任何一方存在染色体数目或结构的异常，就有可能遗传给胎儿，从而引发胎儿停育。比如平衡易位携带者，他们的染色体片段位置发生了改变，但自身表型可能正常，却会增加胎儿染色体异常的风险。胎儿自身染色体异常： 在胚胎发育过程中，由于各种原因导致染色体发生突变，出现数目或结构的异常，这也会致使胎儿无法正常发育，最终造成停育。
母体因素：
内分泌失调： 女性体内的激素水平对维持妊娠至关重要。例如黄体功能不全，会使孕激素分泌不足，无法为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，从而增加胎儿停育的几率。一般来说，黄体期不足11天就可能存在黄体功能不全的情况。甲状腺功能异常也会有影响，甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，会干扰胚胎的正常发育进程。子宫异常： 子宫是胎儿生长发育的场所，如果子宫存在畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会影响胚胎的着床和生长空间；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会影响宫腔内环境，阻碍胚胎发育；子宫内膜炎会破坏子宫内膜的容受性，不利于胚胎着床和发育。
免疫因素：
自身免疫性疾病： 像系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内会产生自身抗体，这些抗体可能攻击胎盘组织，影响胎盘的血液循环，导致胎儿得不到充足的营养和氧气供应，进而引发胎儿停育。同种免疫异常： 母体对胎儿的免疫耐受不足，免疫系统将胎儿视为“异物”进行攻击，也会导致胎儿停育。比如自然杀伤细胞活性过高等情况，就可能破坏胎盘绒毛结构，影响胎儿发育。
环境因素：
化学物质接触： 孕妇长时间接触一些有害的化学物质，如苯、甲醛、农药等，这些化学物质可能会干扰胚胎的正常发育过程，增加胎儿停育的风险。例如长期在新装修且未充分通风的房间居住，室内的甲醛等有害物质可能会对胎儿造成不良影响。辐射暴露： 过高剂量的辐射，如接受X线检查时剂量过高，或者长期处于辐射环境中，都可能损伤胎儿的染色体，影响胚胎发育，导致胎儿停育。一般诊断性的X线检查辐射剂量较低，但如果是多次或高剂量的辐射暴露则风险增加。