脚气伴有灰指甲可通过以下三种方式治疗：一是一般治疗，二是药物治疗，三是手术治疗。具体如下：
一、一般治疗：如果患者平时长期不更换鞋袜，或者长时间运动使得脚部出汗多，汗液积聚在脚部皮肤，对毛囊形成刺激，就可能引发脚气并伴有灰指甲。对此，患者可通过用热水泡脚的方式，来促进脚部的血液流通，帮助恢复脚部皮肤屏障，从而缓解症状。在日常生活中，还需注意穿着舒适宽松的鞋袜，保持脚部干净卫生。
二、药物治疗：患者可在医生的建议下，使用珊瑚癣净、复方酮康唑软膏等药物来涂抹患处，同时口服伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗，以缓解症状。但用药一定要严格按照医生的指示进行，以免错误用药导致病情加重。
三、手术治疗：若患者的脚气和灰指甲情况较为严重，则可通过拔甲或者病甲清除等手术手段来缓解症状。在手术期间，要注意饮食清淡，多喝水，适当进行运动以增强自身免疫力。
总之，对于脚气伴有灰指甲的患者，可根据具体情况选择合适的治疗方法，同时要注意日常护理和生活习惯的调整，以促进病情的恢复和预防复发。