脚气伴有灰指甲可通过一般治疗、药物治疗、手术治疗来处理。具体如下：
一、一般治疗：
如果患者平时长期不更换鞋袜，或是长时间运动使得脚部出汗多，汗液积聚在脚部皮肤，对毛囊形成刺激，就可能引发脚气并伴有灰指甲。此时患者可通过用热水泡脚的方式，来促进脚部血液流通，帮助恢复脚部皮肤屏障，从而缓解症状。在日常生活中，要注意穿着舒适宽松的鞋袜，保持脚部干净卫生。
二、药物治疗：
患者可以遵医嘱使用珊瑚癣净、复方酮康唑软膏等药物来涂抹患处，同时配合口服伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗，以缓解症状。但用药一定要在医生的指导下进行，以免错误用药导致病情加重。
三、手术治疗：
倘若患者的脚气和灰指甲情况较为严重，可通过拔甲或者病甲清除等手术手段来缓解症状。在手术期间要注意饮食清淡，多喝水，并且适当进行运动以增强自身免疫力。
总之，对于脚气伴有灰指甲的情况，要根据具体病情选择合适的治疗方法，同时要注意日常护理和预防。