三个多月宝宝睡觉头摇来摇去可能与以下因素有关：一是环境因素，二是湿疹，三是维生素D缺乏症。
一、环境：如果宝宝睡觉时所处环境温度较高，就可能使其出汗，进而出现睡觉时头摇来摇去的情况。对此，家长可以采取以下措施。一方面可以使用加湿器来适当调节室内温度，让宝宝处于较为舒适的环境中；另一方面可以给宝宝更换薄一些的被子，这样能减少宝宝因过热而不适的情况。
二、湿疹：湿疹容易引发皮肤瘙痒，当宝宝头部有湿疹时，就可能导致其睡觉时头摇来摇去。家长可以在医生指导下，给宝宝使用相关药物进行治疗，比如：
1.炉甘石洗剂：具有收敛和保护皮肤的作用，能缓解湿疹引起的瘙痒等症状。
2.氧化锌软膏：对皮肤有较弱的收敛、滋润和保护作用。
3.丁酸氢化可的松乳膏：有抗炎、止痒及减少渗出的作用。
三、维生素D缺乏症：这是一种全身慢性、营养性疾病，常表现为多汗、睡眠不安等症状，所以宝宝睡觉头摇来摇去可能与之有关。家长可以在医生指导下进行以下处理。一方面可以给宝宝使用一些药物进行治疗，如：
1.碳酸钙颗粒：用于补充钙质。
2.葡萄糖酸钙颗粒：帮助宝宝补充钙元素。
3.乳酸钙颗粒：能起到补钙的效果。另一方面，还可以适当增加宝宝的日照时间，这有利于补钙，对宝宝骨骼发育也有好处。
总之，当发现三个多月宝宝睡觉头摇来摇去时，家长需要仔细观察并分析原因，根据具体情况采取相应的措施，必要时寻求医生的帮助，以确保宝宝的健康和舒适。